Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ShdO88834 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ShdO88834 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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