Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms