Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BlmO88700 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BlmO88700 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BlmO88700 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BlmO88700 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BlmO88700 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BlmO88700 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BlmO88700 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BlmO88700 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BlmO88700 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BlmO88700 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BlmO88700 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BlmO88700 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BlmO88700 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BlmO88700 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BlmO88700 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BlmO88700 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BlmO88700 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BlmO88700 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BlmO88700 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BlmO88700 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BlmO88700 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BlmO88700 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BlmO88700 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BlmO88700 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BlmO88700 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BlmO88700 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BlmO88700 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BlmO88700 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BlmO88700 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BlmO88700 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BlmO88700 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BlmO88700 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BlmO88700 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BlmO88700 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BlmO88700 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BlmO88700 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms