Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms