Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms