Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms