Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms