Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ptpn20O55082 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ptpn20O55082 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ptpn20O55082 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ptpn20O55082 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ptpn20O55082 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ptpn20O55082 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ptpn20O55082 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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