Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms