Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms