Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CrxO54751 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CrxO54751 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CrxO54751 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
CrxO54751 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CrxO54751 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms