Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Nek2O35942 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek2O35942 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nek2O35942 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nek2O35942 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nek2O35942 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nek2O35942 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nek2O35942 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nek2O35942 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nek2O35942 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nek2O35942 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nek2O35942 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nek2O35942 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nek2O35942 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms