Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms