Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pold2O35654 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pold2O35654 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pold2O35654 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pold2O35654 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pold2O35654 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pold2O35654 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pold2O35654 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pold2O35654 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pold2O35654 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pold2O35654 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms