Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag2O35638 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Stag2O35638 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms