Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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