Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc27a2O35488 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms