Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edil3O35474 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms