Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms