Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms