Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna6O35345 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms