Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms