Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms