Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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