Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltaO08585 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltaO08585 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CltaO08585 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltaO08585 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltaO08585 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltaO08585 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltaO08585 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltaO08585 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltaO08585 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltaO08585 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltaO08585 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltaO08585 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltaO08585 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltaO08585 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltaO08585 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltaO08585 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltaO08585 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms