Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp2O08574 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms