Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec22bO08547 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec22bO08547 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Sec22bO08547 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sec22bO08547 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sec22bO08547 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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