Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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