Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm5458L7N219 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gm5458L7N219 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gm5458L7N219 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gm5458L7N219 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gm5458L7N219 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm5458L7N219 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5458L7N219 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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