Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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