Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm8356J3QPD3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm8356J3QPD3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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