Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms