Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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