Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r34G3XA52 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Vmn1r34G3XA52 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Vmn1r34G3XA52 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Vmn1r34G3XA52 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Vmn1r34G3XA52 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms