Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms