Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zkscan2G3X952 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms