Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms