Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms