Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms