Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rdh16f1E9Q9P8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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