Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pate1E9Q658 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms