Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FancfE9Q5Z5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms