Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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