Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc71lE9Q4T4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc71lE9Q4T4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccdc71lE9Q4T4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ccdc71lE9Q4T4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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