Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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