Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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