Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms