Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gcom1E9PZ54 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms