Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms