Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8994E9PV04 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms